微生物组蛋白质组学旨在全面解析复杂微生物群落的蛋白质组成及其功能。微生物组指的是存在于特定环境中的所有微生物的集合，包括细菌、真菌、病毒等。这些微生物群体与宿主之间存在着复杂的相互作用，对宿主的健康、生态系统的平衡以及生物地球化学循环有着重要的影响。通过微生物组蛋白质组学的研究，科学家们可以深入了解微生物群落的功能及其在不同环境中的动态变化。在医学领域，人体微生物组的蛋白质组成研究揭示了微生物与疾病之间的复杂关系，这为疾病的诊断和治疗提供了新的思路。此外，微生物组蛋白质组学在个性化医疗中也具有极大潜力，可以为患者量身定制治疗方案，提高疗效。在农业领域，微生物组蛋白质组学有助于提升农作物的产量和健康。通过研究土壤微生物群落的蛋白质组成，科学家可以识别出有助于植物营养吸收的关键蛋白质。这不仅有助于优化肥料使用，还能促进生态农业的发展。在环境科学中，微生物组蛋白质组学被用于研究污染物的降解过程以及生态系统的稳定性。通过分析环境样本中的微生物群落蛋白质，研究人员可以识别出参与有害物质分解的关键酶类和代谢途径。

一、技术流程

1、样品制备与分离

微生物组蛋白质组学的研究首先涉及样品的制备与分离技术。为了获取准确的蛋白质组数据，样品的处理过程至关重要。微生物组样品通常来自复杂的生物样品，如肠道、土壤或水体。样品处理需要消除宿主蛋白质和其他杂质的干扰，以确保微生物蛋白质的高效分离。常用的方法包括离心、过滤和使用化学试剂进行蛋白质沉淀等。随后利用一维或二维凝胶电泳技术对蛋白质进行分离。高效液相色谱（HPLC）以及毛细管电泳等技术也被广泛应用于蛋白质的分离与纯化。

2、质谱分析与数据处理

质谱分析是微生物组蛋白质组学研究的核心技术。通过质谱仪，科学家能够对分离出的蛋白质进行精确的质量测定，并通过数据库比对进行鉴定。常用的质谱技术包括基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）和液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）。这些技术能够提供蛋白质的分子量、氨基酸序列以及翻译后修饰等信息。数据处理方面，涉及大量的生物信息学工具和算法，用于分析质谱数据并进行蛋白质鉴定和定量。

二、优势与挑战

1、优势

微生物组蛋白质组学提供了一种直接观察微生物群落功能的方式，具有实时监测和动态分析的能力。与传统的基因组学技术相比，微生物组蛋白质组学能够揭示蛋白质的实际功能及其在生物过程中扮演的角色。此外，微生物组蛋白质组学能帮助识别微生物群体中的功能性蛋白质。

2、挑战

尽管微生物组蛋白质组学具有显著的优势，但也面临诸多挑战。微生物群体的复杂性和多样性使得数据分析变得困难，尤其是在识别和量化低丰度蛋白质时。此外，样本制备过程中蛋白质的损失和变性可能影响分析结果的准确性。数据处理和生物信息学分析需要强大的计算能力和专业知识，以应对海量数据和复杂的生物学问题。

百泰派克生物科技致力于提供高质量的样品蛋白质组学服务。我们的团队由经验丰富的科学家组成，结合最先进的质谱技术和全面的生物信息学分析，能够为客户提供全面的蛋白质分析解决方案。通过与百泰派克生物科技合作，您将获得及时可靠的数据支持，加速您的科学发现之旅。我们期待成为您的合作伙伴，共同推进这一激动人心的研究领域。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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