利用二代高通量测序技术，对微生物的16S rDNA及ITS高变区域，分析环境中的细菌、古细菌以及真菌的种类组成和构成，揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的相对丰度、进化关系，进一步探讨微生物多样性。

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高通量测序技术在宏基因组上已被广泛应用。与传统方法相比，高通量测序的宏基因组研究无需构建克隆文库，避免了文库构建过程中宿主菌对样品进行克隆而引起的系统偏差，提高了测序效率，极大地促进了宏基因组学的发展

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